ls11-www.cs.tu-dortmund.de/people/kopczyns/lehre/AAS/SS15/aas_sose15_folien09.pdf
Algorithmen auf Sequenzen - Paarweises Sequenzalignment
Alignment angewendet,
a b b a
b 0 1 0 -1 a 1 1 1 0 b 1 1 1 1 a 2 2 2 1
VB = 0, 1, 0, 1 VC = 0, 1,−1,−1
und in einem Array abgespeichert:
1, 0, 1; 1,−1,−1; aba; bba → 2, 2, 1, 1, 0
D. Kopczynski | Algorithmen [...] Alignment angewendet,
a b b a
b 0 1 0 -1 a 1 1 1 0 b 1 1 1 1 a 2 2 2 1
VB = 0, 1, 0, 1 VC = 0, 1,−1,−1
und in einem Array abgespeichert:
1, 0, 1; 1,−1,−1; aba; bba → 2, 2, 1, 1, 0
D. Kopczynski | Algorithmen [...] ch beträgt O(n log3σ(n)).
F = { ...
1, 0, 0; 1,−1,−1; aba; bba → 1, 2, 1, 1, 0
1, 0, 1; 1,−1,−1; aba; bba → 2, 2, 1, 1, 0
1, 1, 0; 1,−1,−1; aba; bba → 2, 2, 1, 1, 0
...
}
D. Kopczynski | Algorithmen auf …